17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4082 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1090    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  62.7 
 
 
516 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  49.6 
 
 
524 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  51.98 
 
 
515 aa  525  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0637  hypothetical protein  42.56 
 
 
533 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4806  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.15 
 
 
785 aa  312  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3611  hypothetical protein  35.34 
 
 
668 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431512  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08432  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 
637 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  20.67 
 
 
1363 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2838  coagulation factor 5/8 type domain protein  20.12 
 
 
946 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0961558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  25.4 
 
 
681 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  21.57 
 
 
474 aa  53.5  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  22.6 
 
 
1419 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  22.78 
 
 
717 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  21.08 
 
 
477 aa  47  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  25 
 
 
745 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  22.01 
 
 
721 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>