23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4806 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4806  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 785 aa  1555    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  39.87 
 
 		 524 aa  347  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  36.18 
 
 		 515 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  37.37 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0637  hypothetical protein  39.2 
 
 		 533 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  35.36 
 
 		 522 aa  321  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3611  hypothetical protein  34.7 
 
 		 668 aa  313  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431512  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08432  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 		 637 aa  257  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2838  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.04 
 
 		 946 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  25.54 
 
 		 1363 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1419 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  37.07 
 
 		 1309 aa  67.4  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3922  trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.812338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03320  hypothetical protein  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000901964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4882  trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3823  trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.121975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0198  trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.340258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4007  trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3722  trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0194  Alpha,alpha-trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0383252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03367  cytoplasmic trehalase  31.87 
 
 		 549 aa  45.8  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00222705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  24.16 
 
 		 681 aa  44.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3259  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.66 
 
 		 735 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574596  normal  0.459486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>