19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01458 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  42.39 
 
 		 1363 aa  1019    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2838  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.96 
 
 		 946 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  100 
 
 		 1419 aa  2868    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4806  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.19 
 
 		 785 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  33.7 
 
 		 527 aa  102  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2149  hypothetical protein  22.63 
 
 		 516 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243625  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2819  hypothetical protein  22.89 
 
 		 515 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  21.1 
 
 		 522 aa  74.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1813  hypothetical protein  25.45 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  27.8 
 
 		 1309 aa  57.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3611  hypothetical protein  22.55 
 
 		 668 aa  56.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  25.79 
 
 		 800 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  32.54 
 
 		 468 aa  50.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2348  Ig-related protein  34.88 
 
 		 1036 aa  49.3  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0040576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.29 
 
 		 1781 aa  48.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  23.75 
 
 		 619 aa  47.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1756 aa  47.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  25.49 
 
 		 1355 aa  47.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  26.42 
 
 		 781 aa  45.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>