43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2348 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2348  Ig-related protein  100 
 
 		 1036 aa  2045    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0040576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  25.82 
 
 		 1018 aa  170  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3398  hypothetical protein  27.78 
 
 		 974 aa  157  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000354514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3399  hypothetical protein  26.22 
 
 		 947 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000280168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3283  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1182 aa  92.8  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3397  S-layer domain protein  28.63 
 
 		 760 aa  79  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00005416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0438  S-layer domain protein  22.99 
 
 		 1157 aa  77  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  29.73 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.65 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  27.03 
 
 		 1821 aa  55.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  29.69 
 
 		 4630 aa  54.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35.14 
 
 		 1009 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  29.76 
 
 		 1756 aa  52.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1341  hypothetical protein  31.53 
 
 		 967 aa  52.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.274019  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34.78 
 
 		 3027 aa  52  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.34 
 
 		 2313 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 758 aa  50.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  31.75 
 
 		 748 aa  49.3  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  28.57 
 
 		 1208 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1419 aa  48.9  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 1328 aa  48.1  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  30.09 
 
 		 631 aa  48.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2384  S-layer-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 189 aa  48.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  27.96 
 
 		 447 aa  48.1  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  42.31 
 
 		 767 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  31.18 
 
 		 618 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  39.66 
 
 		 1226 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  44.23 
 
 		 685 aa  47  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 548 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 		 1234 aa  47.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  28.29 
 
 		 538 aa  47.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  33.63 
 
 		 609 aa  47  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  40.91 
 
 		 573 aa  46.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  44.44 
 
 		 463 aa  45.8  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  32.69 
 
 		 932 aa  45.8  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 1321 aa  45.8  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  28.99 
 
 		 1710 aa  45.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  40.98 
 
 		 935 aa  45.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1252  putative S-layer protein  27.56 
 
 		 341 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.09 
 
 		 926 aa  45.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  52.94 
 
 		 625 aa  45.1  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  27.14 
 
 		 520 aa  44.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  29.11 
 
 		 413 aa  44.7  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>