19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1341 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1341  hypothetical protein  100 
 
 		 967 aa  1926    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.274019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0536  hypothetical protein  28.74 
 
 		 865 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0595  hypothetical protein  34 
 
 		 336 aa  109  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0140  hypothetical protein  23.8 
 
 		 822 aa  88.2  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0538  hypothetical protein  30.34 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0482  hypothetical protein  37.61 
 
 		 402 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  38.1 
 
 		 5743 aa  55.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2792  hypothetical protein  34.26 
 
 		 396 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2348  Ig-related protein  31.53 
 
 		 1036 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0040576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0154  hypothetical protein  33.02 
 
 		 401 aa  51.2  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2028  OmpA family protein  34.07 
 
 		 1338 aa  50.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00257067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3283  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1182 aa  48.9  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  30.95 
 
 		 565 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  39.81 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  36.49 
 
 		 221 aa  46.2  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  35 
 
 		 539 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  32.56 
 
 		 218 aa  45.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  37.68 
 
 		 221 aa  44.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  34.17 
 
 		 294 aa  44.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>