266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3105 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  71.1 
 
 
218 aa  294  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  58.9 
 
 
221 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  50.99 
 
 
221 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  51.49 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  41.87 
 
 
220 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  40.69 
 
 
223 aa  164  9e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  39.6 
 
 
225 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  39.51 
 
 
225 aa  148  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  39.02 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  36.67 
 
 
230 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  37.5 
 
 
222 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  34.54 
 
 
222 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  37.13 
 
 
265 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  33.33 
 
 
218 aa  117  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  37.63 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  36.09 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.97 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  35.08 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  42.18 
 
 
226 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  30.84 
 
 
234 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  32.04 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  32.04 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  36.87 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  36.87 
 
 
228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  35.09 
 
 
227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  33.14 
 
 
222 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  32.18 
 
 
229 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  31.65 
 
 
220 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  32.02 
 
 
221 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  31.34 
 
 
221 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  30.46 
 
 
235 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 
235 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  30.81 
 
 
221 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  30.77 
 
 
224 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  34.32 
 
 
222 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  32.81 
 
 
220 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  34.65 
 
 
223 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  32.6 
 
 
225 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  38.36 
 
 
223 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  33.02 
 
 
263 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  35.44 
 
 
242 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 
226 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  37.44 
 
 
228 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  35.12 
 
 
226 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  37.76 
 
 
221 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  30.26 
 
 
224 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  35.56 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  33.85 
 
 
228 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  31.51 
 
 
222 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  29.83 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
232 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
232 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  34.81 
 
 
221 aa  99  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
232 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
232 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  30.05 
 
 
225 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  33.85 
 
 
232 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  29.59 
 
 
229 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  35.6 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  34.15 
 
 
232 aa  98.2  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  28.5 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  35.08 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  31.84 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  31.84 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2595  flagellar basal body rod modification protein  34.82 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.613344  hitchhiker  0.000000237471 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  35.88 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  35.88 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  33.74 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  28.06 
 
 
293 aa  95.9  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  35.1 
 
 
228 aa  95.5  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2048  flagellar basal body rod modification protein  28.57 
 
 
235 aa  95.1  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.854141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  32.65 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0041  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 
294 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0080  flagellar basal body rod modification protein  31.25 
 
 
294 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  30.05 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  34.76 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  30.91 
 
 
224 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  31.82 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  32.47 
 
 
253 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  31.46 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  32.47 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  30.22 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  31.16 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0057  flagellar basal body rod modification protein  31.07 
 
 
287 aa  90.1  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  32.12 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  33.55 
 
 
278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  33.14 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  33.14 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  33.14 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  32.57 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  32.57 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  32.57 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  32.45 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  32.57 
 
 
231 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  33.55 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  35.06 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>