19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0595 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0595  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  685    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0538  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  288  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1341  hypothetical protein  34 
 
 
967 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.274019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0536  hypothetical protein  32.01 
 
 
865 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0140  hypothetical protein  25.87 
 
 
822 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1174  N-terminal methylation motif domain protein  27.17 
 
 
530 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13610  predicted protein  27.31 
 
 
208 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  34.69 
 
 
5743 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  34.62 
 
 
221 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 
221 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  37.66 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  27.75 
 
 
567 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3453  Spore coat protein CotH  27.94 
 
 
798 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0950404  normal  0.13091 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  36.67 
 
 
215 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  36.67 
 
 
215 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  35 
 
 
1347 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 
221 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  32.94 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  32.94 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>