24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0953 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  100 
 
 		 1347 aa  2716    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  32.37 
 
 		 1296 aa  595  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  35.03 
 
 		 1125 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  32.2 
 
 		 1152 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1278 aa  491  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1279 aa  432  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1123 aa  427  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1110 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1134 aa  112  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1017 aa  112  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1267 aa  102  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  25.23 
 
 		 882 aa  98.2  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  26.55 
 
 		 865 aa  94.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  26.38 
 
 		 882 aa  93.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  26.01 
 
 		 884 aa  93.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  42.72 
 
 		 468 aa  60.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1685 aa  58.9  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  23.81 
 
 		 994 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1086 aa  48.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1343 aa  48.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  21.94 
 
 		 996 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  40.24 
 
 		 741 aa  47.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5106  hypothetical protein  23.21 
 
 		 857 aa  45.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  37.8 
 
 		 668 aa  45.1  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>