268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4206 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  100 
 
 
221 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  61.39 
 
 
221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  59.41 
 
 
218 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  62.26 
 
 
218 aa  246  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  61.88 
 
 
221 aa  245  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  38.61 
 
 
220 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  40.1 
 
 
223 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  37.02 
 
 
218 aa  141  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  36.55 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  36.55 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  36.55 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  35.08 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  34.57 
 
 
263 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  35.29 
 
 
230 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  38.42 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  39.69 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  41.18 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 
226 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  33.89 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  31.66 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  32.11 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  36.13 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  31.63 
 
 
229 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  34.16 
 
 
221 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  34.16 
 
 
221 aa  109  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  34.38 
 
 
222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  35.71 
 
 
222 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  37.93 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  33 
 
 
221 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  34.98 
 
 
223 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  37.44 
 
 
233 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  37.7 
 
 
218 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  34.81 
 
 
225 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  39.89 
 
 
222 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  39.51 
 
 
278 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7244  putative flagellar basal-body rod modification protein FlgD  30.84 
 
 
235 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  34.15 
 
 
226 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  38.36 
 
 
223 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  34.48 
 
 
226 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  36.96 
 
 
280 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  34.64 
 
 
226 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  38.27 
 
 
280 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  32.16 
 
 
221 aa  102  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  30.57 
 
 
225 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  38.27 
 
 
280 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  34.38 
 
 
220 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  33.89 
 
 
265 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  37.43 
 
 
277 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  33.02 
 
 
220 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  34.52 
 
 
229 aa  102  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  37.43 
 
 
277 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  37.43 
 
 
277 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  37.43 
 
 
277 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  39.43 
 
 
231 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
222 aa  101  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  38.86 
 
 
231 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  38.86 
 
 
231 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  38.86 
 
 
231 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  38.18 
 
 
248 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  38.86 
 
 
231 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  38.18 
 
 
248 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  30 
 
 
293 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  38.29 
 
 
231 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  38.29 
 
 
231 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  37.58 
 
 
248 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  37.58 
 
 
248 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  37.17 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  34.2 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  36.97 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  31.98 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.98 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  39.33 
 
 
248 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  34.1 
 
 
224 aa  98.6  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  38.95 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0113  flagellar hook capping protein  35.71 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  31.47 
 
 
263 aa  98.2  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  33.67 
 
 
218 aa  98.2  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  32.83 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  37.24 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  37.41 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  29.21 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  38.29 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  36.97 
 
 
251 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  29.59 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  36.22 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  32.28 
 
 
235 aa  95.5  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  37.09 
 
 
224 aa  94.7  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  37.67 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  37.67 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  31.19 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  34.69 
 
 
240 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  33.7 
 
 
228 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  35.44 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  33.7 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  34.12 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>