266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2565 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  100 
 
 
225 aa  435  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  99.11 
 
 
225 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  95.56 
 
 
225 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  40.1 
 
 
218 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  43.87 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  42.86 
 
 
242 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  40.3 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  40.59 
 
 
235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  36.73 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  39.49 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  37.56 
 
 
218 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  37.31 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  34.36 
 
 
265 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  37.95 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  38.14 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  37.88 
 
 
233 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  39.38 
 
 
229 aa  125  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  34.85 
 
 
222 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  35.68 
 
 
226 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  36.18 
 
 
220 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2211  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  38.3 
 
 
238 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  34.02 
 
 
223 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  37.8 
 
 
226 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  35.04 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  36.76 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  38.14 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  35.75 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  35.75 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  36.81 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  38.58 
 
 
221 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  38.58 
 
 
221 aa  118  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  32.14 
 
 
221 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2950  flagellar basal body rod modification protein  38.02 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.427206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1331  flagellar basal body rod modification protein  34.76 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2960  flagellar basal body rod modification protein  33.81 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3098  flagellar basal body rod modification protein  33.81 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  35.53 
 
 
220 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1261  flagellar basal body rod modification protein  33.8 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1418  flagellar basal body rod modification protein  33.81 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  40.88 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  40.88 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  34.72 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  34.72 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  38.93 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  32.66 
 
 
226 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  36.2 
 
 
221 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  35.98 
 
 
225 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2945  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 
256 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  38.18 
 
 
251 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  38.67 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  28.57 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1163  flagellar basal body rod modification protein  32.39 
 
 
261 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  35.53 
 
 
235 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  32.31 
 
 
234 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  37.16 
 
 
227 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1347  flagellar basal body rod modification protein  31.43 
 
 
260 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.796846  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  35 
 
 
222 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  38.93 
 
 
248 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  35.84 
 
 
222 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  38.93 
 
 
248 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 
280 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  35.82 
 
 
225 aa  105  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3085  flagellar basal body rod modification protein  30.99 
 
 
282 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  30.43 
 
 
221 aa  105  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 
280 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 
277 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 
277 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  32.29 
 
 
222 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 
277 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 
277 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  38.16 
 
 
280 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  33.8 
 
 
227 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  38.82 
 
 
278 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1599  flagellar basal body rod modification protein  30.52 
 
 
270 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  38.83 
 
 
233 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  34.18 
 
 
224 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3248  flagellar basal body rod modification protein  33.8 
 
 
253 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  36.56 
 
 
228 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1342  flagellar basal body rod modification protein  30 
 
 
270 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  35.09 
 
 
221 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  33.67 
 
 
224 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  38.31 
 
 
222 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0142  flagellar basal body rod modification protein  38 
 
 
240 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  35.84 
 
 
228 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1219  flagellar hook capping protein  36.36 
 
 
226 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.248011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  38.31 
 
 
223 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1323  flagellar basal body rod modification protein  32.71 
 
 
259 aa  101  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  36.73 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3792  flagellar basal body rod modification protein  36 
 
 
240 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  32.16 
 
 
235 aa  98.2  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  36.41 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2595  flagellar basal body rod modification protein  30.52 
 
 
253 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  35.42 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2376  flagellar hook capping protein  35.03 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1305  flagellar basal body rod modification protein  29.52 
 
 
263 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3098  flagellar basal body rod modification protein  29.95 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  36.41 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2316  flagellar basal body rod modification protein  31.55 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004171  flagellar basal-body rod modification protein FlgD  36.91 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  35.93 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>