210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2055 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  100 
 
 		 565 aa  1136    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  35.56 
 
 		 523 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  31.57 
 
 		 539 aa  273  6e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.54 
 
 		 535 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  30.74 
 
 		 528 aa  230  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  35.52 
 
 		 581 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.44 
 
 		 1266 aa  101  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  37.39 
 
 		 1041 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  35.37 
 
 		 863 aa  97.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  32.43 
 
 		 772 aa  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  34.08 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  24.24 
 
 		 954 aa  88.2  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.78 
 
 		 348 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.78 
 
 		 348 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.18 
 
 		 1107 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.27 
 
 		 400 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  27.47 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  27.23 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  30.24 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.38 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  24.24 
 
 		 1012 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.13 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  26.41 
 
 		 643 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  29.57 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  25.1 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  34.82 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.17 
 
 		 867 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  29.76 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.21 
 
 		 1679 aa  80.5  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1351 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  23.4 
 
 		 993 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.61 
 
 		 242 aa  80.1  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  25 
 
 		 995 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  34.21 
 
 		 713 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.73 
 
 		 766 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.4 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  25.55 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  25.33 
 
 		 1088 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.87 
 
 		 763 aa  77.8  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.22 
 
 		 1263 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.71 
 
 		 1015 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.98 
 
 		 892 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  23.72 
 
 		 994 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  26 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1059 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  26.92 
 
 		 760 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  27.71 
 
 		 755 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  31.48 
 
 		 776 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.92 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  27.78 
 
 		 772 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.51 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  36.84 
 
 		 484 aa  72  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  27.14 
 
 		 760 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  24.62 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  25 
 
 		 1070 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  25 
 
 		 1070 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  29.17 
 
 		 788 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.5 
 
 		 765 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  25 
 
 		 1112 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.02 
 
 		 467 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  29.17 
 
 		 788 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.12 
 
 		 1024 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.5 
 
 		 779 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.75 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  22.65 
 
 		 1011 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  25.53 
 
 		 1290 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  37.98 
 
 		 1389 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.92 
 
 		 631 aa  67.8  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  28.79 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  24.44 
 
 		 399 aa  67  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.3 
 
 		 2132 aa  65.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  26.14 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  25.82 
 
 		 789 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  25.82 
 
 		 789 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  30.23 
 
 		 1749 aa  65.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  34.62 
 
 		 886 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.28 
 
 		 937 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.47 
 
 		 307 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  31.91 
 
 		 401 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.66 
 
 		 937 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  32.85 
 
 		 1052 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.3 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  36.76 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1395 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  32.84 
 
 		 388 aa  62  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1744 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  26.2 
 
 		 765 aa  60.5  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.51 
 
 		 1395 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  31.76 
 
 		 757 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  33.55 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  29.39 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  27.31 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 1085 aa  58.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.68 
 
 		 1344 aa  58.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.38 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  39.45 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  26.5 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  26.84 
 
 		 972 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  29.06 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>