155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0822 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  100 
 
 		 523 aa  1051    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  36.74 
 
 		 528 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  34.72 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  35.56 
 
 		 565 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.42 
 
 		 535 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  33.5 
 
 		 355 aa  90.9  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.09 
 
 		 1266 aa  90.1  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.89 
 
 		 863 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  36.91 
 
 		 1041 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  39.9 
 
 		 1015 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.97 
 
 		 772 aa  87.4  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  32.58 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  27.31 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.97 
 
 		 1679 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  27.57 
 
 		 1070 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  27.57 
 
 		 1112 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  27.57 
 
 		 1070 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  27.8 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  26.83 
 
 		 1088 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  32.11 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  28.86 
 
 		 995 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  29.59 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  22.85 
 
 		 766 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  25.22 
 
 		 760 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  32.79 
 
 		 484 aa  69.7  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  23.91 
 
 		 766 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.3 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  23.48 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.57 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  28 
 
 		 763 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  24.78 
 
 		 760 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  39.15 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  26.82 
 
 		 772 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.18 
 
 		 531 aa  67  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  27.18 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  27.73 
 
 		 765 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.02 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  27.73 
 
 		 779 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.02 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  27.73 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35.23 
 
 		 937 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  32.32 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  29 
 
 		 877 aa  62.4  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  43 
 
 		 713 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  33.84 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1351 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.66 
 
 		 937 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1389 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29 
 
 		 1263 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  34.22 
 
 		 788 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  22.73 
 
 		 954 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  34.22 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  38.69 
 
 		 892 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  34.22 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  22.27 
 
 		 993 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  22.27 
 
 		 1012 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  35.98 
 
 		 776 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  38.74 
 
 		 587 aa  57.4  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  31.84 
 
 		 277 aa  57  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.14 
 
 		 2132 aa  57  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  27.39 
 
 		 603 aa  57  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  31.82 
 
 		 2262 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.09 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.53 
 
 		 1344 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.16 
 
 		 867 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  36.76 
 
 		 886 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.64 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 447 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 453 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  30.17 
 
 		 583 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 460 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1744 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1052 aa  54.7  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  43.69 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  33.58 
 
 		 558 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.65 
 
 		 296 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  25.68 
 
 		 400 aa  53.9  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  25 
 
 		 1335 aa  53.5  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  34.92 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  25.22 
 
 		 789 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  25.22 
 
 		 789 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.75 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  24.38 
 
 		 994 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  25.54 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  24.84 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2054  hypothetical protein  32.35 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  37.86 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  37.78 
 
 		 1749 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  27.19 
 
 		 284 aa  52.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  27.33 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.93 
 
 		 972 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  23.39 
 
 		 858 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 459 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  30.67 
 
 		 647 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  32.46 
 
 		 446 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>