94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0025 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  100 
 
 
388 aa  758    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  36.84 
 
 
776 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  33.93 
 
 
788 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  33.93 
 
 
788 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  33.93 
 
 
788 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  42.34 
 
 
622 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  41.94 
 
 
318 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  35.2 
 
 
755 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  35.2 
 
 
755 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  35.2 
 
 
731 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  34.15 
 
 
603 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  44.22 
 
 
568 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  42.45 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  34.89 
 
 
765 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  42.4 
 
 
615 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  39.71 
 
 
547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  40.4 
 
 
581 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  41.2 
 
 
284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  35.2 
 
 
755 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  41.12 
 
 
583 aa  116  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  35.51 
 
 
565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  34.33 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  38.8 
 
 
574 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 
763 aa  106  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  44.29 
 
 
375 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  46.84 
 
 
323 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  31.3 
 
 
545 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  35.78 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.19 
 
 
1263 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  29.93 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.39 
 
 
1351 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.73 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  43.97 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.85 
 
 
508 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  25.49 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.46 
 
 
1041 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  26.75 
 
 
379 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.84 
 
 
565 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.66 
 
 
482 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.42 
 
 
1107 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  32.77 
 
 
535 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30.62 
 
 
416 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.06 
 
 
867 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  29.27 
 
 
757 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.57 
 
 
1344 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.63 
 
 
467 aa  51.2  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.51 
 
 
1749 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.4 
 
 
863 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.52 
 
 
713 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  37.23 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.05 
 
 
937 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
450 aa  50.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  26.09 
 
 
279 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  33.33 
 
 
523 aa  50.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03833  hypothetical protein  25.37 
 
 
2710 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.05 
 
 
937 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.46 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  27.72 
 
 
1335 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  39.36 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  33.92 
 
 
452 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.03 
 
 
1024 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.8 
 
 
1015 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  24.64 
 
 
489 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  34.78 
 
 
434 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  29.76 
 
 
447 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  28.96 
 
 
1266 aa  46.2  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  28.72 
 
 
2198 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
453 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  26.35 
 
 
539 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  36.42 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  27.39 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  27.75 
 
 
1088 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  32.09 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  22.9 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28415  hypothetical protein  27.49 
 
 
677 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.460739  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.93 
 
 
448 aa  44.7  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  27.06 
 
 
630 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  27.8 
 
 
1780 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  31.11 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.44 
 
 
476 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  29.57 
 
 
559 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  25.5 
 
 
523 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 
437 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  29.9 
 
 
432 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  41.18 
 
 
497 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  25.3 
 
 
347 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  29.02 
 
 
419 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
447 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>