166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0459 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 581 aa  1179    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  37.79 
 
 		 763 aa  191  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  45.92 
 
 		 788 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  45.92 
 
 		 788 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  45.92 
 
 		 788 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  47.15 
 
 		 776 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  40.4 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  40.8 
 
 		 583 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  35.52 
 
 		 565 aa  107  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  37.16 
 
 		 568 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  32.91 
 
 		 4071 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  40.32 
 
 		 574 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  37.67 
 
 		 755 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  37.67 
 
 		 765 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  41.72 
 
 		 565 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  36.28 
 
 		 755 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  36.28 
 
 		 755 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  36.28 
 
 		 731 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  37.5 
 
 		 603 aa  99.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  31.28 
 
 		 689 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.8 
 
 		 2833 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  30.37 
 
 		 384 aa  96.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.05 
 
 		 1679 aa  94.4  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  40.44 
 
 		 547 aa  94  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  37.01 
 
 		 657 aa  87.8  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  41.94 
 
 		 4896 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  38.73 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  36.22 
 
 		 648 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  39.9 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  41.01 
 
 		 545 aa  84.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.84 
 
 		 535 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  35.85 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  35.29 
 
 		 622 aa  80.5  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  37.21 
 
 		 631 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  40.32 
 
 		 2377 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  26.97 
 
 		 379 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  48.42 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  43.53 
 
 		 1483 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  35.75 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  39.13 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  41.67 
 
 		 2402 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  32.7 
 
 		 637 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  45.35 
 
 		 599 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  31.06 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  27.63 
 
 		 379 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1313 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  37.57 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  40.43 
 
 		 3927 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  30.6 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  39.33 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  41.92 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  41.76 
 
 		 3793 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.13 
 
 		 1041 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  30.45 
 
 		 1111 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1067 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  34.07 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  29.56 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1287 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  37.5 
 
 		 742 aa  64.3  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.97 
 
 		 1371 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  27.89 
 
 		 815 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1980 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  28.5 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 3324 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1389 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  30.34 
 
 		 938 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  35.21 
 
 		 867 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  35.38 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  35.63 
 
 		 863 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  35.48 
 
 		 950 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  25.45 
 
 		 496 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.87 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  37.1 
 
 		 969 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  35.16 
 
 		 2270 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  24.34 
 
 		 750 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  36.26 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  37.1 
 
 		 963 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  31.16 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.17 
 
 		 885 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.05 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  25 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.66 
 
 		 713 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1059 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  35.48 
 
 		 968 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  34.51 
 
 		 1152 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1245 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.4 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.79 
 
 		 937 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.8 
 
 		 3471 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  30.21 
 
 		 5745 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.7 
 
 		 3737 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.15 
 
 		 1230 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  28.57 
 
 		 2807 aa  57  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  27.33 
 
 		 496 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.48 
 
 		 1389 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1064 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.79 
 
 		 937 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  28.57 
 
 		 2411 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>