153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2225 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  100 
 
 		 2402 aa  4673    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  43.7 
 
 		 2262 aa  523  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  29.4 
 
 		 6497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  33.84 
 
 		 1547 aa  338  5.999999999999999e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1804 aa  332  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.65 
 
 		 2270 aa  283  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  27.38 
 
 		 5298 aa  275  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  36.84 
 
 		 561 aa  274  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.35 
 
 		 3793 aa  273  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  35.7 
 
 		 1064 aa  256  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  27.76 
 
 		 1463 aa  251  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.38 
 
 		 2713 aa  238  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  29.84 
 
 		 874 aa  177  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  29.08 
 
 		 759 aa  161  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  24.35 
 
 		 3958 aa  152  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  25.73 
 
 		 5544 aa  138  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 885 aa  122  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  33.13 
 
 		 890 aa  122  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  26.35 
 
 		 3794 aa  117  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  37.38 
 
 		 532 aa  115  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1139 aa  113  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.71 
 
 		 1068 aa  111  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  25.43 
 
 		 4044 aa  107  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  29.27 
 
 		 1657 aa  103  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1163 aa  101  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  38.14 
 
 		 1980 aa  100  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  25.29 
 
 		 1483 aa  99.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  40 
 
 		 1679 aa  97.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.18 
 
 		 540 aa  95.9  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  28.87 
 
 		 535 aa  95.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1193 aa  94  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  34.02 
 
 		 534 aa  92.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.08 
 
 		 989 aa  89.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  30.17 
 
 		 1222 aa  88.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  34.24 
 
 		 1288 aa  87.4  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  45.83 
 
 		 3927 aa  85.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1329 aa  85.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1287 aa  85.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  47.62 
 
 		 2377 aa  84  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  32.88 
 
 		 503 aa  84  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  23.55 
 
 		 967 aa  80.9  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42.53 
 
 		 4896 aa  80.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  31.04 
 
 		 1247 aa  79.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  29.54 
 
 		 4071 aa  77.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  44.71 
 
 		 599 aa  77.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  29.01 
 
 		 1266 aa  76.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  41.67 
 
 		 581 aa  74.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1059 aa  74.7  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.96 
 
 		 1585 aa  74.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  37.27 
 
 		 3471 aa  74.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  30.44 
 
 		 1672 aa  73.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  31.63 
 
 		 1108 aa  71.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  43.04 
 
 		 648 aa  71.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  36.56 
 
 		 711 aa  71.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  31.25 
 
 		 1152 aa  71.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  41.18 
 
 		 1067 aa  70.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  35.71 
 
 		 652 aa  70.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.95 
 
 		 3227 aa  69.7  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  31.52 
 
 		 1474 aa  68.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  41.77 
 
 		 657 aa  68.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  28.5 
 
 		 815 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.05 
 
 		 1607 aa  68.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  33.02 
 
 		 3737 aa  67.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.78 
 
 		 5745 aa  67  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  42.17 
 
 		 315 aa  66.6  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  29.75 
 
 		 991 aa  66.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  36.45 
 
 		 615 aa  65.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  31.45 
 
 		 2367 aa  65.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  31.45 
 
 		 2411 aa  65.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  27.35 
 
 		 1002 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.96 
 
 		 4978 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1111 aa  63.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2555  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1310 aa  63.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942961  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  39.02 
 
 		 3602 aa  63.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  28.61 
 
 		 1217 aa  62  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  32.8 
 
 		 2807 aa  62.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.37 
 
 		 1673 aa  61.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  29.27 
 
 		 2296 aa  61.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  24.5 
 
 		 511 aa  61.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.43 
 
 		 3324 aa  60.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  25.09 
 
 		 952 aa  60.8  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  26.43 
 
 		 2927 aa  61.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  30.36 
 
 		 918 aa  60.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  27.08 
 
 		 1526 aa  60.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  29.73 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  33.68 
 
 		 968 aa  59.3  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  42.47 
 
 		 4013 aa  58.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  38.97 
 
 		 742 aa  58.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.02 
 
 		 2772 aa  58.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  38.55 
 
 		 735 aa  57.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  37.63 
 
 		 969 aa  57.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  37.63 
 
 		 963 aa  57  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1676  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1460 aa  57.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  32.05 
 
 		 642 aa  56.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.92 
 
 		 1152 aa  56.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.82 
 
 		 799 aa  56.6  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  31.58 
 
 		 950 aa  56.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.71 
 
 		 3542 aa  56.2  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  28.8 
 
 		 938 aa  56.2  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.87 
 
 		 792 aa  55.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>