37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1018 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  100 
 
 		 952 aa  1869    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1230  thermopsin  41.26 
 
 		 320 aa  186  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1460  thermopsin  38.85 
 
 		 586 aa  176  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2683  Thermopsin  34.74 
 
 		 556 aa  140  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1218  peptidase A5, thermopsin  32.59 
 
 		 944 aa  134  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00267921  normal  0.64223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1231  peptidase A5, thermopsin  27.05 
 
 		 924 aa  97.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0086  hypothetical protein  30.94 
 
 		 562 aa  84  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.876374  normal  0.238085 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1285  hypothetical protein  30.42 
 
 		 671 aa  84.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.328698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1064 aa  64.7  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.43 
 
 		 5298 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  25.52 
 
 		 2402 aa  59.7  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  24.57 
 
 		 2713 aa  58.2  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  25.42 
 
 		 561 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  23.96 
 
 		 1463 aa  54.7  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1479  S-layer domain protein  25.5 
 
 		 1545 aa  54.3  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  30.11 
 
 		 534 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1362 aa  52  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  24.51 
 
 		 1154 aa  51.2  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  25.46 
 
 		 2262 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  22.04 
 
 		 2552 aa  50.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  25.68 
 
 		 3911 aa  50.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  33.13 
 
 		 935 aa  49.3  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  30.21 
 
 		 6497 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  25.1 
 
 		 1232 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  24.57 
 
 		 2272 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  25 
 
 		 679 aa  47  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  25.35 
 
 		 1672 aa  47  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  34.78 
 
 		 1544 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  33.97 
 
 		 918 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  37.33 
 
 		 2656 aa  46.2  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1804 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  26.76 
 
 		 885 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0017  hypothetical protein  28.35 
 
 		 400 aa  45.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1879 aa  45.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  25.84 
 
 		 540 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.66 
 
 		 1969 aa  45.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  25.96 
 
 		 552 aa  44.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>