| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | Cmaq_1218 |
|---|
| Symbol | |
|---|
| ID | 5709730 |
|---|
| Type | CDS |
|---|
| Is gene spliced | No |
|---|
| Is pseudo gene | No |
|---|
| Organism name | Caldivirga maquilingensis IC-167 |
|---|
| Kingdom | Archaea |
|---|
| Replicon accession | NC_009954 |
|---|
| Strand | + |
|---|
| Start bp | 1286810 |
|---|
| End bp | 1289644 |
|---|
| Gene Length | 2835 bp |
|---|
| Protein Length | 944 aa |
|---|
| Translation table | 11 |
|---|
| GC content | 40% |
|---|
| IMG OID | 641275722 |
|---|
| Product | peptidase A5, thermopsin |
|---|
| Protein accession | YP_001541035 |
|---|
| Protein GI | 159041783 |
|---|
| COG category | |
|---|
| COG ID | |
|---|
| TIGRFAM ID | |
|---|
| 
|
Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 5 |
|---|
| Plasmid unclonability p-value | 0.00267921 |
|---|
| Plasmid hitchhiking | Yes |
|---|
| Plasmid clonability | hitchhiker |
|---|
| |
Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | 34 |
|---|
| Fosmid unclonability p-value | 0.64223 |
|---|
| Fosmid Hitchhiker | No |
|---|
| Fosmid clonability | normal |
|---|
| |
Sequence |
| Gene sequence | ATGAATGTTC CTGAGTCAGT AATATTCATT GTTATTTTAA CAATCACCTC AGCGTTAATC
ACTAATGCTC AATCAGCCGC CTGCTGGTAC TATTGGCCTA ACGTTAACGT TAACCTTGGT
CAAGGATTAC TGGTTAAGGT AATGAACGGG TCCTATAACC TATACGTATT CACACCAACC
CAGTACGCTA AGTGGAGTAG CGGCAGCGGT GGGTACGCCG TATACGCAGG TAGCGTTACT
GTGGGTGCCT ACCTTGTACG CATCCCCCCT GGTTCATACT ACGTGGTGCT CTACCCCACT
CAATGCGGCA GCATCGTTAA CGCCGGTATT AATGTTATTG GTTTAGCCCC AACGGGTTTA
TCATCAATAA TACCCATCAA CACCACTGCG GTTTTAGGCT ACTTCAATAT AAGTATTATT
AGGGCTTGGA ATGCAAGCTA CACCGCAGTC AACGTACTAA GGGTACCTAA GAGTAGTGCC
AGTCTTCAAT TAAATGCAGT AGTGCGAGTT GAGTTAATTA ATGGTAGTTT CCAGGAGTAT
TGGCTTCAAG ATGCTTTAAT CTTCATTACG AGTAATGGAG TCTTCAGTGT TGCTGATAAT
GTCTGGAACG CCACTGCCCC TGGGGCTAAT GTATCAAGCA GCTTAATCAC TGGACTAGGT
AGGGTTTACA ATGCCGTGGG CGTTAGCCAG GAGTATTACG GGTACGTGGG TAATTTAACT
AGGTACCAGT TACCTTTATC AGGTTACCTT GAGGTTAACG TAACCTTAAT TAACGATTCA
GTGGTGGTTA TGTTCGGTTA CGCAATAGTG AGGAATGGAA GCACCTACGC ACCACCGGTA
ATTAAGTGGT TTGATAACGT GACCCTGGGG ATTAAGGCTA AGGATGCGTT AATAGTAACT
ACCCCATATG AGGAGACGGG TGGTGGATAC GCGTATGATG TTGAGTTAGT CTTTGGGGGA
GGCTTTAATG GTGAGCAAAC CACCTTTGAG AGCCTTAATG CTCAATTAGC CGTAATGCAC
TGGAGTGGAT CTGGTTGGGT ACCTTATAGT CAAGTCTATA ACTTCGGCAT GAACACTGGG
GAATCAGCAA CAGACCTAGT GACCTCAATA TCAAGTAACG GTAATGTGCA AGTCACCGTG
GGTATACCAT ACTACGGTGA GTTAACCAAT GACTTCAAAC CAACCATACC CACAAGCTTC
ATTGAGGTCA TTTACCCAAA CAGCACTGTG AAAGGCTTCT ACACGTTCAA AGAAACCACA
GTAACCTTGC CCAGGGTGAT AATTAGTAAT GGTGTCACCT ACATCTTCAA AGGCATTGAT
GAGTCATGTA ATGGGGCAAC GCGATTAATT AGAAATAACT CAGCAACAGT GACCCCAAGC
ATTAACGCGT TCTCAACATG CGTTATAAGG GGGAATTATA GTACGTACTT CTTATTGAGA
CTTAAGTCAC AATACCCCAT TAATATTACC CTGGTTAATG GCACATTCAC AGTAACTAAT
ATGGAGAGCT GGTTACCTGC AAACTCATCA CTGGTGATTA GGGTTAAGGC AATCTACCCA
CTCAGTAACT TAACGAGGGT TAAGACTATT AATGAGACTT TAATTAACAT GACTGTTAGG
GAGCCGTTAA ACTTAACCAT TGAGTGGATT AGGCAGTATT TTGTCAGGGT TATGAGTATT
GTCCCAATTA ATGTTAATGG TTCATTAACA TTAAGTTACT TTAACTGGAT TAACAACGGC
TCTGTCTTGG AGTTATCAAT ACCAAGCTTC ATGTACTTCA ATAATGGGAG TAGGTTAATG
GCCTTGAATA AATCCAGGGT AATTATAGTG GTTACGCATC CATTAAACAT CACTACGTCA
TGGGTTAGGC AGTACTTAGT TAACATTAGT AGCATTGCCC CAATTCTAAT TAACGGTAAT
TACTCAATTA ATTATGTTCA GTGGATTAAT TCAGGCAGTA TCATTAACGT GACTGTGCCT
AAGTACTATT ACCTTAACGG TAGTGTAAGG TTAATGGCGC TTAATTCATC AATTTTAATA
ACAGTTAATA ACCCCATTAA GGCCACTGTA AAGTGGGTTA GGCAGTACTT GATTGAAGTT
AATAGTATTG TCCCCGTAAT GGTGAATGAG TCTCAATTAA CCTCATTAAT TAATTGGCTT
AATGAATCAA GCACATTAAT TATTAATGCG CAGCCTCAAT ACTACTTCAA TAATGGAACC
AGGTTAATCC TACTTAATTC AAGCGAAATT AAAGTAATCA TCAATAAGCC ACTTAACCTA
ACCATTGAGT GGGTTAGACA ATATTTGGTT AATGTAACCA GTTCAGCACC ATTAATGGTA
AATGACACCT TAGTGAAGTC AATACAGGAT TGGTTTAACT CAAGTTCATT ACTCAATATT
ACGCTTACAA TTCAATACTT CAATAATGGA ACCAGGTTAC TTCCCTTAAA CTCCTCATTA
ATCCTCATTA AGGTTAATAA GCCTCTTAAC CTGACTGTTA ACTGGGTTAG GCAGTACTTA
GTTAATTTAA CAAGCCCAAT AGCCTTAAAC ATTAACGGCA CTGTGTCTAG GAATTACTCC
AGATGGATTA ACGCTAGTGA TTTAATAATC CTAAATGGGC CGCTTAGGAT TCTTGAAGTT
AATTTAACCA TAATTAAATT AGCCTCCGTA TCAATTAATG GTCAGCTTCA CTACTCATTG
CCAATTAACC TGACGGTTAA TGAACCCTTA ATGATTAAGG TTAATTGGGT TAGGGATTAC
ATAGTCTACT ATTCATTGGT ATTATTAGTG ATTGTTATTG TATTAATCCT GGTTGCTTCA
CGCCGTGGTG GTTAA
|
|---|
| Protein sequence | MNVPESVIFI VILTITSALI TNAQSAACWY YWPNVNVNLG QGLLVKVMNG SYNLYVFTPT
QYAKWSSGSG GYAVYAGSVT VGAYLVRIPP GSYYVVLYPT QCGSIVNAGI NVIGLAPTGL
SSIIPINTTA VLGYFNISII RAWNASYTAV NVLRVPKSSA SLQLNAVVRV ELINGSFQEY
WLQDALIFIT SNGVFSVADN VWNATAPGAN VSSSLITGLG RVYNAVGVSQ EYYGYVGNLT
RYQLPLSGYL EVNVTLINDS VVVMFGYAIV RNGSTYAPPV IKWFDNVTLG IKAKDALIVT
TPYEETGGGY AYDVELVFGG GFNGEQTTFE SLNAQLAVMH WSGSGWVPYS QVYNFGMNTG
ESATDLVTSI SSNGNVQVTV GIPYYGELTN DFKPTIPTSF IEVIYPNSTV KGFYTFKETT
VTLPRVIISN GVTYIFKGID ESCNGATRLI RNNSATVTPS INAFSTCVIR GNYSTYFLLR
LKSQYPINIT LVNGTFTVTN MESWLPANSS LVIRVKAIYP LSNLTRVKTI NETLINMTVR
EPLNLTIEWI RQYFVRVMSI VPINVNGSLT LSYFNWINNG SVLELSIPSF MYFNNGSRLM
ALNKSRVIIV VTHPLNITTS WVRQYLVNIS SIAPILINGN YSINYVQWIN SGSIINVTVP
KYYYLNGSVR LMALNSSILI TVNNPIKATV KWVRQYLIEV NSIVPVMVNE SQLTSLINWL
NESSTLIINA QPQYYFNNGT RLILLNSSEI KVIINKPLNL TIEWVRQYLV NVTSSAPLMV
NDTLVKSIQD WFNSSSLLNI TLTIQYFNNG TRLLPLNSSL ILIKVNKPLN LTVNWVRQYL
VNLTSPIALN INGTVSRNYS RWINASDLII LNGPLRILEV NLTIIKLASV SINGQLHYSL
PINLTVNEPL MIKVNWVRDY IVYYSLVLLV IVIVLILVAS RRGG
|
|---|
| |