65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1552 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  100 
 
 		 1544 aa  3079    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  35.46 
 
 		 1626 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  33.76 
 
 		 1672 aa  147  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  39.29 
 
 		 1232 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.35 
 
 		 692 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.7 
 
 		 1673 aa  131  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  37.71 
 
 		 1879 aa  130  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.38 
 
 		 1272 aa  118  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.88 
 
 		 3911 aa  116  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  52 
 
 		 603 aa  103  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  32.23 
 
 		 1222 aa  95.9  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.1 
 
 		 3544 aa  94.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.16 
 
 		 3542 aa  94.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  52.63 
 
 		 610 aa  90.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  59.15 
 
 		 631 aa  90.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.08 
 
 		 1394 aa  89.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.97 
 
 		 2522 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  58.62 
 
 		 608 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  46.15 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.21 
 
 		 2402 aa  75.5  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  38.37 
 
 		 509 aa  74.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  30.77 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  36.43 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  38.24 
 
 		 556 aa  72.8  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  44.74 
 
 		 257 aa  72  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  44.32 
 
 		 1145 aa  70.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.39 
 
 		 3699 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.53 
 
 		 680 aa  70.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  42.11 
 
 		 343 aa  69.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  45.35 
 
 		 1129 aa  69.3  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  45.21 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.57 
 
 		 193 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.91 
 
 		 648 aa  67.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1104 aa  67  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.05 
 
 		 3699 aa  66.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  28.66 
 
 		 2079 aa  64.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  31.21 
 
 		 3244 aa  63.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.02 
 
 		 878 aa  63.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  36.36 
 
 		 891 aa  62.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  30.23 
 
 		 1263 aa  62.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.38 
 
 		 3563 aa  61.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  47.44 
 
 		 1030 aa  58.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  29.38 
 
 		 683 aa  56.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.08 
 
 		 887 aa  55.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  36.94 
 
 		 2375 aa  54.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  30.93 
 
 		 1123 aa  54.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  46.77 
 
 		 471 aa  52.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  34.17 
 
 		 618 aa  52  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2777  hypothetical protein  34.34 
 
 		 169 aa  51.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  25.39 
 
 		 731 aa  50.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  34.31 
 
 		 311 aa  50.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.97 
 
 		 11716 aa  48.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5693  Fibronectin type III domain protein  42.47 
 
 		 566 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.69156  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2831  Ig family protein  30.63 
 
 		 443 aa  47.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  0.161271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.85 
 
 		 1001 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  30.64 
 
 		 1170 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  40.82 
 
 		 150 aa  47  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0172  hypothetical protein  37.04 
 
 		 398 aa  46.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  34.78 
 
 		 952 aa  46.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2582  hypothetical protein  37.5 
 
 		 370 aa  46.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0495255  hitchhiker  0.0081508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  38.89 
 
 		 321 aa  46.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2215  hypothetical protein  46.94 
 
 		 157 aa  45.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  30.07 
 
 		 646 aa  45.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1802 aa  45.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.27 
 
 		 3598 aa  45.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>