28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2391 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 631 aa  1263    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  50 
 
 		 603 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  58.57 
 
 		 1544 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  52.86 
 
 		 1626 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  57.97 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  60.34 
 
 		 608 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  35.04 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.68 
 
 		 648 aa  70.9  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  32.93 
 
 		 1067 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  40 
 
 		 1104 aa  65.1  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.38 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  38.04 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  32.11 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  37.08 
 
 		 556 aa  63.5  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  43.37 
 
 		 1145 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  35.87 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  34.94 
 
 		 275 aa  56.6  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  43.59 
 
 		 499 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.48 
 
 		 680 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  34.86 
 
 		 1076 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2528  hypothetical protein  38.27 
 
 		 321 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000345829  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  39.08 
 
 		 277 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2750  hypothetical protein  44.44 
 
 		 150 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.606258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  34.91 
 
 		 3802 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2215  hypothetical protein  34.48 
 
 		 157 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  40.58 
 
 		 137 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.33 
 
 		 1550 aa  43.9  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  37.97 
 
 		 864 aa  43.9  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>