17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1649 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  67.19 
 
 		 509 aa  185  8e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  55.56 
 
 		 454 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  52.38 
 
 		 556 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  39.36 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  56.35 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  39.76 
 
 		 1626 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  45.21 
 
 		 1544 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  34.83 
 
 		 631 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  38.16 
 
 		 610 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.78 
 
 		 680 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  41.94 
 
 		 608 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  32.89 
 
 		 603 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.74 
 
 		 648 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00862  hypothetical protein  29.27 
 
 		 337 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.329819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1145 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>