20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0231 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  100 
 
 		 556 aa  1129    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  44.11 
 
 		 903 aa  213  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  62.4 
 
 		 509 aa  177  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  50 
 
 		 343 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  64.23 
 
 		 454 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  52.41 
 
 		 257 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  56.1 
 
 		 275 aa  153  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0030  hypothetical protein  45.52 
 
 		 334 aa  117  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0864  hypothetical protein  42.34 
 
 		 170 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00415115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  40.26 
 
 		 1626 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  41.1 
 
 		 1544 aa  65.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  37.08 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  36.84 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  31 
 
 		 603 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.62 
 
 		 680 aa  54.3  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  43.55 
 
 		 608 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.06 
 
 		 648 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1145 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 193 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0728  putative Ig  33.65 
 
 		 1126 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.218703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>