23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0334 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0334  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  694    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  83.74 
 
 		 454 aa  219  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  49.15 
 
 		 556 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  56.25 
 
 		 509 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1649  hypothetical protein  57.26 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1253  hypothetical protein  54.84 
 
 		 257 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  41.89 
 
 		 1626 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  39.73 
 
 		 1544 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  35.87 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  38.36 
 
 		 610 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.72 
 
 		 680 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  34.25 
 
 		 603 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0343  hypothetical protein  28.97 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  41.94 
 
 		 608 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  23.5 
 
 		 193 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 648 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0351  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 553 aa  47.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0345  hypothetical protein  26.76 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  52.08 
 
 		 5526 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3236  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1074 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 		 2539 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0342  hypothetical protein  27.34 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1145 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>