30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1798 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  65.14 
 
 		 1104 aa  1477    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  100 
 
 		 1145 aa  2318    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1292 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2740  hypothetical protein  44.12 
 
 		 610 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0048024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  47.06 
 
 		 1544 aa  66.6  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1501  hypothetical protein  48.28 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.96972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3712  hypothetical protein  47.06 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000102893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2391  fibronectin, type III domain-containing protein  43.37 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00263498  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5582  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.79 
 
 		 193 aa  62  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  42.65 
 
 		 1626 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2387  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.65 
 
 		 680 aa  53.5  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.900198  decreased coverage  0.000000289366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.21 
 
 		 648 aa  52.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4247  hypothetical protein  41.89 
 
 		 137 aa  50.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  27.04 
 
 		 295 aa  47.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0231  Ig family protein  31.71 
 
 		 556 aa  48.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0007  peptidylprolyl isomerase  29.76 
 
 		 509 aa  47  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5693  Fibronectin type III domain protein  48.61 
 
 		 566 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.69156  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  35.09 
 
 		 287 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  34.48 
 
 		 281 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  35 
 
 		 282 aa  47.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  35.09 
 
 		 287 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  32.2 
 
 		 269 aa  46.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  35.09 
 
 		 282 aa  46.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  34.48 
 
 		 277 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  35.09 
 
 		 282 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  35.09 
 
 		 282 aa  46.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  34.48 
 
 		 287 aa  46.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  34.48 
 
 		 282 aa  46.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  35.71 
 
 		 290 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 265 aa  44.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>