34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0464 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  51.25 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  50.36 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  48.2 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  48.94 
 
 		 290 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  48.2 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  47.84 
 
 		 282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  46.24 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  48.04 
 
 		 287 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  47.33 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  47.2 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  47.2 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  44.72 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  43.32 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  44.24 
 
 		 277 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  43.12 
 
 		 269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  33.67 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  32.88 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  28.52 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  28.03 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  25.86 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  23 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  26.6 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  27.08 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  21.3 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  24.3 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  32.98 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  30.53 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  24.39 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  26.22 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  43.75 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1798  hypothetical protein  35 
 
 		 1145 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  35 
 
 		 1104 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  31.67 
 
 		 567 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>