36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00261 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  29.3 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  29.35 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  27.14 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  26.87 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  28.83 
 
 		 287 aa  89.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  27.76 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  27.56 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  27.76 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  26.98 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  24.64 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  31.62 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  25.09 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  25.18 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  26.45 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  25.86 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  24.19 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  25.69 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  36.21 
 
 		 192 aa  72  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  26.28 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  26.07 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  26.74 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  26.52 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  28.77 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  28.26 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  36.56 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  26.89 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  27.03 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  25.64 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  27.21 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  27.87 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.21 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  39.76 
 
 		 125 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  33.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  34.85 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  27.63 
 
 		 235 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>