67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0813 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  91.06 
 
 		 235 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  51.05 
 
 		 237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  32.22 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  28.99 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  31.49 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0655  hypothetical protein  33.71 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167321  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.36 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  52.24 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  43.66 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  39.71 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  34.58 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  39.73 
 
 		 341 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  30.45 
 
 		 283 aa  65.1  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  28.87 
 
 		 288 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  41.54 
 
 		 343 aa  62  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  40.91 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  40.91 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  30.99 
 
 		 355 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  30.99 
 
 		 355 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.63 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  40.35 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  26.25 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  39.39 
 
 		 332 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  31.4 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  35.71 
 
 		 429 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.27 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  34.92 
 
 		 357 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.33 
 
 		 330 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  21.52 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  34.33 
 
 		 334 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  33.33 
 
 		 316 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  32.35 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  31.33 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  25.61 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  25.24 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  29.33 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  30.49 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  28.75 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  24.27 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  28 
 
 		 322 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  29.33 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  29.33 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  29.35 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2022  hypothetical protein  38.71 
 
 		 337 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  36.51 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.33 
 
 		 337 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  21.56 
 
 		 270 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.46 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  29.87 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.63 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.67 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  31.75 
 
 		 323 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.57 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  25.68 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28 
 
 		 333 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  32.05 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.6 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.6 
 
 		 178 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0974  hypothetical protein  35.87 
 
 		 182 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  32.22 
 
 		 324 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  27.63 
 
 		 251 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.27 
 
 		 353 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>