88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0726 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  33.95 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  29.91 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  30.4 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  31.45 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  27.08 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  30.47 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  28.49 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  29.91 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.2 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  27.68 
 
 		 349 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  27.84 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.81 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  25.64 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  25.22 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  25.94 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  30.27 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.92 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  27.04 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  28.12 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  24.56 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  24.65 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  25.66 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.28 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  31.94 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  31.94 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  31.94 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  31.94 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  26.13 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  32.08 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  26.13 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  25.66 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  31.56 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  22.76 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.15 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  26.97 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  26.71 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  45.33 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  26.86 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  39.13 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  31.2 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  25.06 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  28.3 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.32 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  37.5 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  26.25 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  32.02 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  45.16 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  46.97 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  40.85 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  36.92 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  27.83 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  26.26 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  26.7 
 
 		 242 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  38.46 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  26.59 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  24.54 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  36.96 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  44.26 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  25.09 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  32.94 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  32.94 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  37.7 
 
 		 357 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  31.34 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  29.77 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  39.34 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.94 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  31.78 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  30.84 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  34.33 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  30.12 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  29.35 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  33.87 
 
 		 227 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  37.7 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  30.43 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.81 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3186  hypothetical protein  35.9 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  37.7 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  34.62 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0827  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.46 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  35.38 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  26.43 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  23.12 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.04 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0862  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.52 
 
 		 189 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  25.64 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2370  hypothetical protein  32.5 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  32.81 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>