46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0781 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  100 
 
 		 310 aa  620  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  43.32 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  37.14 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  34.47 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  37.14 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  33.95 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  29.37 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  26.55 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  29.71 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  29.67 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  24.73 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.16 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.21 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  23.62 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  23.62 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  24.62 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  23.31 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.18 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  30.48 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.98 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  24.39 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.91 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  25.18 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  27.08 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  24.53 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.21 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  26.86 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  22.71 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  32.24 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  32.24 
 
 		 434 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  30.05 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  31.84 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  31.84 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  31.84 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  31.84 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.06 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.7 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.14 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  29.9 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  31.68 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  40.74 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.92 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  31.34 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  29.89 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  34.43 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>