33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2445 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  567  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  63.43 
 
 
270 aa  338  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  65.02 
 
 
269 aa  334  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  55.04 
 
 
261 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  55.04 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  55.04 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  55.04 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  55.04 
 
 
434 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  55.04 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  53.88 
 
 
342 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  54.65 
 
 
261 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  47.06 
 
 
279 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  46.27 
 
 
279 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  45.06 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  45.56 
 
 
278 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  31.87 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  28.12 
 
 
334 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  28.15 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  27.34 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  30.24 
 
 
286 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  28.85 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  29.96 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  29.3 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  29.39 
 
 
310 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.55 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  28.95 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  24.56 
 
 
303 aa  55.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  22.36 
 
 
353 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  29.08 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  27.86 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  34.43 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  25.13 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  24.12 
 
 
242 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.492835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>