38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4553 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  65.09 
 
 		 212 aa  277  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  62.91 
 
 		 214 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0655  hypothetical protein  60 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167321  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  31.06 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  29.83 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  28.99 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  45.45 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  40 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  37.97 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  39.44 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  37.14 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  37.88 
 
 		 418 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  37.88 
 
 		 418 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  37.31 
 
 		 343 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  28.43 
 
 		 429 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  34.38 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  41.43 
 
 		 344 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  41.43 
 
 		 344 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  27 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.18 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  23.08 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  24.21 
 
 		 270 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  32.84 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  32.86 
 
 		 347 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  41.38 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  30.16 
 
 		 357 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  32.05 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  24.21 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  33.87 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  40 
 
 		 316 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  29.85 
 
 		 334 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.38 
 
 		 178 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  29.23 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.38 
 
 		 178 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.35 
 
 		 290 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  31.25 
 
 		 395 aa  41.6  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>