23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1863 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  37.31 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  40.85 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  35.42 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  28.38 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  33.87 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0680  putative type IV pilus assembly protein PilW  26.27 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  24.35 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  39.13 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.43 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  32.26 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  32.81 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.35 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  34.85 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  25.25 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1864  hypothetical protein  25.81 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  33.9 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  34.18 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  23.53 
 
 		 395 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  29.07 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  26.5 
 
 		 195 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  36.51 
 
 		 236 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>