37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2942 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  41.92 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.4 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3211  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0227647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3145  hypothetical protein  30.13 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3325  hypothetical protein  30.13 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0234254 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  27.06 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  37.31 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  23.49 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3267  hypothetical protein  25.17 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  22.82 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  22.82 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  22.82 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2972  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157774  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3162  hypothetical protein  29.05 
 
 		 174 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.371591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3145  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0305853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2971  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0866  prepilin peptidase dependent protein B  25.32 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0890  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02634  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02673  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.315688  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3037  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4090  hypothetical protein  25.32 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171812  normal  0.628463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  30.08 
 
 		 341 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3225  hypothetical protein  28.38 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0159896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  28.77 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3436  hypothetical protein  29.84 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  23.29 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0960  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  35.23 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.775575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.66 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  34.92 
 
 		 385 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  32.88 
 
 		 343 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  25.49 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  38.16 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  34.29 
 
 		 397 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0680  putative type IV pilus assembly protein PilW  23.68 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  32.31 
 
 		 342 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>