88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3227 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  692    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  37.69 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  36.42 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  33.82 
 
 		 344 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  33.53 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  32.33 
 
 		 429 aa  146  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  33.72 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  30.25 
 
 		 388 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  27.86 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  30.65 
 
 		 385 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.9 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  26.82 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  26.82 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.93 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  26.37 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  28.49 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.17 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  27.87 
 
 		 322 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  29.07 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  28.53 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  28.65 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.22 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  26.89 
 
 		 329 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  24.79 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.17 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.5 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  26.12 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  24.77 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  25.55 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  24.61 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  34.04 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  25.47 
 
 		 357 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  33.09 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  39.73 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  33.09 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  25.08 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  26.69 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  36.99 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.76 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  36.73 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  40.98 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.91 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  30.94 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.71 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.5 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  29.51 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  38.89 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  28.57 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  24.53 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  41.94 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  37.14 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  41.27 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  21.76 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  36.92 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  35.82 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  24.2 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  26.19 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  34.74 
 
 		 388 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  29.77 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  31.18 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  35.48 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  31.25 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  31.76 
 
 		 397 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  31.68 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  30.95 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  28.57 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  30.08 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  31.51 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0487  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.66 
 
 		 259 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  35.71 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  34.52 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0402  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  29.41 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2913  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  23.05 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  24.18 
 
 		 341 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2677  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  39.13 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  23.2 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1864  hypothetical protein  29.87 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  23.2 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  23.28 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2880  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  27.96 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  35.82 
 
 		 236 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  23.73 
 
 		 398 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0960  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  23.39 
 
 		 282 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.775575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3436  hypothetical protein  30.3 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  26.03 
 
 		 217 aa  43.9  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  28.79 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2883  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  35.29 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0655  hypothetical protein  34.72 
 
 		 213 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167321  normal  0.529795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>