42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2553 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  100 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0487  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.17 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3436  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.32 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  39.68 
 
 		 343 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0663  hypothetical protein  37.88 
 
 		 423 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.87 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0629  hypothetical protein  36.36 
 
 		 423 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1124  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  35.21 
 
 		 429 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.04 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  40.3 
 
 		 344 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  33.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2092  hypothetical protein  28.91 
 
 		 160 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.473403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  32.79 
 
 		 346 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1511  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000444179  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3429  hypothetical protein  32.18 
 
 		 307 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0674  hypothetical protein  37.1 
 
 		 420 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  30.3 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  39.71 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  31.9 
 
 		 326 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  29.63 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  39.71 
 
 		 316 aa  45.8  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  43.66 
 
 		 397 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  35.82 
 
 		 341 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  36.51 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  26.47 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  26.47 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0585  hypothetical protein  24.26 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  35.48 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0213  hypothetical protein  30.3 
 
 		 421 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0961  hypothetical protein  37.29 
 
 		 550 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.209127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  27.16 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  27.22 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  28.79 
 
 		 388 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1864  hypothetical protein  30.77 
 
 		 367 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  36.51 
 
 		 290 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  30.53 
 
 		 328 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1034  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1104 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.881671 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0756  general secretion pathway protein J  33.96 
 
 		 258 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.602108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>