79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01322 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  100 
 
 		 388 aa  789    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  55.15 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  39.57 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  39.24 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  31.38 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  30.25 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  29.04 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  28.42 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  25.91 
 
 		 429 aa  96.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  26.42 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  25.94 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  25.78 
 
 		 373 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  26.22 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  25.77 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  43.66 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  40.85 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.93 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.22 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.97 
 
 		 328 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  42.42 
 
 		 212 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.73 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.67 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  26.41 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  35.71 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  23.74 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  25.67 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  26.92 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  38.89 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  38.89 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  25.06 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  38.89 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  38.03 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  39.44 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  38.89 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  45.71 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  39.44 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  39.47 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  29.38 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  33.33 
 
 		 274 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  24.01 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  43.08 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  29.07 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  42.86 
 
 		 329 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  40.62 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  38.33 
 
 		 226 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40 
 
 		 340 aa  53.9  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  40.91 
 
 		 322 aa  53.9  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  34.29 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  30.3 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  37.31 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  39.24 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  38.1 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  39.34 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  39.34 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  23.03 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2677  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  22.31 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2913  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  23.77 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  38.1 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  38.71 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  33.85 
 
 		 290 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60290  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  31.67 
 
 		 275 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623405 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.1 
 
 		 250 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0851  hypothetical protein  26.32 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3427  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.66 
 
 		 180 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  38.6 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0707  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.66 
 
 		 180 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3315  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.66 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  31.25 
 
 		 227 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  37.7 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1698  hypothetical protein  31.91 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2520  hypothetical protein  38.89 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  28.83 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  27.94 
 
 		 217 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  34.72 
 
 		 270 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  25.76 
 
 		 382 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0402  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  23.72 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  31.15 
 
 		 303 aa  43.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>