53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1214 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  653    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.18 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  39.57 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.56 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  39.14 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  39.14 
 
 		 322 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  38.84 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  38.84 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  39.25 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  39.56 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  39.26 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.2 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  39.27 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.54 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  39.75 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  37.27 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  36.23 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  25.88 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  24.14 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  24.04 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2677  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  25.14 
 
 		 336 aa  89.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  24.39 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  25.55 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0402  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  26 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  26.06 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2913  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  23.12 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  24.56 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  25 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2880  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  23.91 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  23.08 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  39.06 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  40.91 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  43.33 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  23.17 
 
 		 398 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  25.68 
 
 		 226 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  38.98 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  30.19 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  32.04 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.18 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1698  hypothetical protein  43.75 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  30.77 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  39.66 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  32.81 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  40.35 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  36.21 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  40.35 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  28.57 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.29 
 
 		 178 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.29 
 
 		 178 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  34.43 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  42.11 
 
 		 303 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.35 
 
 		 226 aa  42.4  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>