50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2913 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2913  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  100 
 
 		 345 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2677  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  68.22 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  56.89 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0402  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  55.14 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  33.69 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  28.83 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2880  putative type 4 fimbrial biogenesis pilw-related protein transmembrane  29.17 
 
 		 391 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.66 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.14 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.71 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.27 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  25.43 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.07 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.92 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  23.12 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.28 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  25.53 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  23.41 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  22.38 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  22.38 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  22.29 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  22.09 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  25.21 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  25.67 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  24.93 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  23.77 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  26.51 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  23.36 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  24.44 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  24.38 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  27.45 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.31 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  34.25 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1698  hypothetical protein  39.66 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.43 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  37.84 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  35.85 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  35.14 
 
 		 215 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  32.86 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  26.8 
 
 		 237 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  31.08 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  36.07 
 
 		 226 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  30.38 
 
 		 418 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  38.36 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  30.38 
 
 		 418 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5192  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  30.85 
 
 		 274 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.25172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  29.73 
 
 		 235 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  25.8 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>