83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0212 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  100 
 
 		 344 aa  699    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  34.29 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  32.67 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  33.72 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  32.6 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  32.96 
 
 		 344 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  29.75 
 
 		 343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  28.42 
 
 		 388 aa  99.4  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  27.95 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  27.08 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  27.03 
 
 		 418 aa  92  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.99 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  25.75 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.4 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.93 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  50.75 
 
 		 212 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  34.58 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  38.67 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.47 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  24.52 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  24.52 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.08 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  24.66 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  24.67 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  40 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  25.08 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  24.5 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  23.68 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  27.58 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.43 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  37.8 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  42.31 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  26.97 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  25.85 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  35.37 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  37.88 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  24.92 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  23.5 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  39.19 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  41.67 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  37.97 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  25.52 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  36.17 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  25.69 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  43.75 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  25.81 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  34.48 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  25.26 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  31.58 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  38.03 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  38.71 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  23.45 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  40.3 
 
 		 236 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  38.24 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  33.33 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.79 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  37.7 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  34.67 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  24.04 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  40.3 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3252  Type IV pili fiber-building block protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  30.56 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  40.91 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  33.9 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  27.42 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004286  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  39.39 
 
 		 196 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0851  hypothetical protein  28.77 
 
 		 185 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  37.5 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  33.9 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  33.87 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2022  hypothetical protein  35 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  38.16 
 
 		 227 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.88 
 
 		 269 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  25.16 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  25.16 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0827  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.71 
 
 		 189 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0707  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.41 
 
 		 180 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3427  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.41 
 
 		 180 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  37.14 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0862  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.87 
 
 		 189 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0850  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.87 
 
 		 185 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.764335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  35 
 
 		 253 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>