42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3038 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2907  type IV pilus assembly protein PilW  29.55 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  27.04 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2520  hypothetical protein  27.25 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  40.32 
 
 		 385 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  41.27 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2666  hypothetical protein  27.83 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  40.91 
 
 		 235 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  29.51 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  39.39 
 
 		 235 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  26.92 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  36.36 
 
 		 215 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  26.42 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1698  hypothetical protein  20.52 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  31.67 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  39.34 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  38.24 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.46 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  37.31 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  35.16 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  38.1 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  38.1 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  38.1 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  38.1 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  41.27 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  36.14 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.31 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0969  type IV pilin, putative  31.87 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1084  hypothetical protein  31.87 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  36.23 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  32.86 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  32.86 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.1 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  37.97 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  31.51 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.85 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  23.74 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  35.48 
 
 		 212 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.72 
 
 		 340 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  28.79 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  36.11 
 
 		 214 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  37.1 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>