19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2002 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  793    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  31.76 
 
 		 341 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  37.7 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  37.97 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  43.66 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0663  hypothetical protein  35.82 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  32.67 
 
 		 347 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1807  hypothetical protein  26.67 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0487  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  35.23 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0629  hypothetical protein  34.33 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2883  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.88 
 
 		 264 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  34.38 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  33.87 
 
 		 344 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  25.27 
 
 		 342 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  34.29 
 
 		 227 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  23.05 
 
 		 342 aa  43.1  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  31.08 
 
 		 303 aa  42.7  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>