49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0649 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  65.09 
 
 		 215 aa  277  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  62.5 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0655  hypothetical protein  62.62 
 
 		 213 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167321  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  31.12 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  32.78 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  32.22 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  40.91 
 
 		 385 aa  62  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  38.24 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  36.17 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  38.03 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  38.89 
 
 		 341 aa  58.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  38.16 
 
 		 418 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  38.16 
 
 		 418 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  37.88 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  38.95 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  35.71 
 
 		 429 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  26.61 
 
 		 346 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  32.84 
 
 		 334 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.23 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  42.86 
 
 		 344 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  42.86 
 
 		 344 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  36 
 
 		 316 aa  48.5  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  36 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  29.08 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  28.5 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  30.16 
 
 		 357 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.75 
 
 		 328 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  26.57 
 
 		 273 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  26.5 
 
 		 303 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  31.25 
 
 		 347 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  33.87 
 
 		 288 aa  45.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  31.65 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  33.82 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.75 
 
 		 328 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.91 
 
 		 330 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  30.77 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  30.38 
 
 		 322 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  33.33 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  35.48 
 
 		 332 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0648  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.16 
 
 		 327 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  27.47 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  33.33 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  30.77 
 
 		 334 aa  42.4  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  31.25 
 
 		 326 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.39 
 
 		 207 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  26.89 
 
 		 395 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  30.3 
 
 		 290 aa  41.6  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>