19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0235 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  47.72 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2022  hypothetical protein  31.93 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  30.33 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  25.75 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  25.8 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  47.54 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  31.4 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  31.36 
 
 		 235 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  34.67 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  40.68 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  26.5 
 
 		 212 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  26.67 
 
 		 385 aa  45.8  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  23.12 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.94 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  31.15 
 
 		 388 aa  43.1  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  31.08 
 
 		 397 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  42.11 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  23.05 
 
 		 334 aa  42.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>