62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5182 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  29.11 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  27.55 
 
 		 270 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  28.31 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  25.22 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  28.08 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  25.98 
 
 		 269 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  25.24 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.6 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  24.57 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  27.69 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.37 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  25.42 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  26.02 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  26.02 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  26.02 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  22.51 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  26.02 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  26.02 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  26.02 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  22.22 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.62 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  22.29 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  25.15 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  21.94 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.05 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  27.53 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  25 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  28.83 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  26.75 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  23.78 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  28.89 
 
 		 286 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  23.33 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  33.73 
 
 		 395 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  23.28 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  24.01 
 
 		 283 aa  52.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  22.04 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  33.33 
 
 		 388 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  24.37 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  23.56 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  22.6 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  31.75 
 
 		 290 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  23.81 
 
 		 327 aa  50.1  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  31.72 
 
 		 346 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  24.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.49 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  22.22 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  22.03 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  24.59 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  23.28 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  27.11 
 
 		 373 aa  46.2  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2837  putative type 4 fimbrial biogenesis PilW-related protein transmembrane  28.57 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  31.15 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  25.85 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.05 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  21.55 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  23.48 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.58 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5687  Type IV fimbrial biogenesis pilW-related transmembrane protein  31.88 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  24.23 
 
 		 418 aa  43.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  29.41 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  24.23 
 
 		 418 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>