34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2661 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  100 
 
 		 341 aa  689    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  39.55 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  40.4 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  30.47 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  29.37 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  25.63 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  27.34 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  25.65 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  27.09 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  24.21 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  39.62 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  23.72 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  26.21 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  24.18 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  23.79 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.17 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  23.42 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  25.2 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  25.85 
 
 		 334 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  35.38 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  36.92 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  25.15 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  22.56 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  24.8 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  25.94 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  22.53 
 
 		 373 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.19 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  36.67 
 
 		 226 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  31.11 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  21.99 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  24.19 
 
 		 250 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.92 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  37.1 
 
 		 217 aa  42.7  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  28.22 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>