29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0720 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  55.3 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  55.96 
 
 		 310 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  36.51 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  36.02 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  31 
 
 		 328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  26.32 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  29.39 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  29.92 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2661  putative transmembrane protein  28.82 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  24.12 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  25.61 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  31.2 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  27.39 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  24.02 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  30.94 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  30.94 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  30.94 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  30.94 
 
 		 261 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  30.94 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  30.57 
 
 		 261 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  28.78 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  27.09 
 
 		 279 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.89 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  28.94 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.06 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  32.31 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  26.23 
 
 		 242 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  30.07 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>