34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3899 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  79.78 
 
 
279 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  79.78 
 
 
279 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  71.58 
 
 
278 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  53.64 
 
 
342 aa  248  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  54.33 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  54.33 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  54.33 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  54.33 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  54.33 
 
 
261 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  54.33 
 
 
434 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  49.43 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  49.03 
 
 
269 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  53.94 
 
 
261 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  45.06 
 
 
280 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.76 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  27.08 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  30.18 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.72 
 
 
353 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  25.63 
 
 
334 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  27.24 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  27.52 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  27.12 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  23.73 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  27.89 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  27.67 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  25.56 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  30.85 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  41.38 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3827  hypothetical protein  34.33 
 
 
382 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.365962  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0487  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  25 
 
 
259 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01138  hypothetical protein  35.21 
 
 
210 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  24.34 
 
 
286 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  23.35 
 
 
226 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>