47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2071 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1938  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0838  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2672  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2071  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3230  putative type IV pilus protein  99.62 
 
 
261 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3192  putative type IV pilus protein  99.23 
 
 
261 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3245  hypothetical protein  99.62 
 
 
434 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1382  hypothetical protein  88.85 
 
 
342 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  58.56 
 
 
269 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  56.11 
 
 
270 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0687  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  57.09 
 
 
279 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0704  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  57.48 
 
 
279 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978225  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3899  hypothetical protein  54.33 
 
 
277 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2577  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  55 
 
 
278 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252558  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2445  hypothetical protein  55.04 
 
 
280 aa  235  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  31.18 
 
 
328 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  30.47 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.74 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  31.25 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  30.59 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  29.43 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  29.81 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0781  transmembrane protein  31.84 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.903144  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0720  hypothetical protein  31.2 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  25.88 
 
 
334 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  24.39 
 
 
353 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  26.4 
 
 
226 aa  62.4  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0712  hypothetical protein  26.86 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.72 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  25.36 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0668  putative transmembrane protein  27.8 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.983511  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  27.8 
 
 
349 aa  49.7  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  28.85 
 
 
212 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  30.08 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  35.29 
 
 
385 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  24.71 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  31.43 
 
 
346 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  33.87 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  35.64 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5189  hypothetical protein  28.99 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.448312  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  33.33 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  30 
 
 
397 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2823  putative transmembrane protein  29.47 
 
 
349 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  26.47 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  26.01 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  34.48 
 
 
388 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>