38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3012 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3193  hypothetical protein  56.19 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  49.47 
 
 		 203 aa  194  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  48.94 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  46.49 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  46.49 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  45.95 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3819  putative prepilin peptidase dependent protein  49.4 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21629  normal  0.274461 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3145  hypothetical protein  34.59 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3325  hypothetical protein  34.59 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0234254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3211  hypothetical protein  34.05 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0227647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3267  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3037  hypothetical protein  30.48 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2972  hypothetical protein  30.48 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157774  hitchhiker  0.00584782 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0866  prepilin peptidase dependent protein B  30.48 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0890  hypothetical protein  30.48 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2971  hypothetical protein  30.48 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3145  hypothetical protein  29.95 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0305853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4090  hypothetical protein  29.95 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171812  normal  0.628463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.371591  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02673  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.315688  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02634  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0159896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  31.95 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  25.73 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  31.78 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  26.95 
 
 		 236 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  23.29 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  23.91 
 
 		 290 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3427  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.24 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0707  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.24 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3315  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.24 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  34.92 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0851  hypothetical protein  36.76 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3406  fimbrial biogenesis protein  37.7 
 
 		 398 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004286  type 4 fimbrial biogenesis protein PilW  25.96 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  26.5 
 
 		 290 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  31.75 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0360831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>