31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0218 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  100 
 
 		 290 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  32.4 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2931  fimbrial biogenesis protein  24.18 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.91 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  40.85 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3166  prepilin-type cleavage/methylation-like  25.41 
 
 		 210 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  30 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  31.08 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  31.25 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  38.71 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  31.75 
 
 		 334 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0680  putative type IV pilus assembly protein PilW  25.32 
 
 		 201 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0213  hypothetical protein  31.58 
 
 		 421 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  34.21 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  33.85 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3012  hypothetical protein  23.91 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1038  hypothetical protein  24.58 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3236  hypothetical protein  24.58 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.723853  normal  0.49379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0986  hypothetical protein  24.58 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.810424  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  34.29 
 
 		 418 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  34.29 
 
 		 418 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  30.65 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.26 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  30.16 
 
 		 346 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  31.34 
 
 		 429 aa  43.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0909  hypothetical protein  25.41 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.63 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.63 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0266  hypothetical protein  27.69 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.343829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3394  hypothetical protein  24.57 
 
 		 203 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03019  putative prepilin peptidase dependent protein  22.84 
 
 		 220 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>