29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0855 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  100 
 
 		 178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  100 
 
 		 178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  38.89 
 
 		 343 aa  51.6  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  35.35 
 
 		 385 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  35.09 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  37.29 
 
 		 322 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.63 
 
 		 290 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  42.25 
 
 		 316 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3315  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.35 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  38.6 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1977  hypothetical protein  32.79 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  36.84 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1972  hypothetical protein  32.79 
 
 		 268 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0707  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.35 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3427  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.35 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  34.38 
 
 		 215 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.15 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  40.28 
 
 		 316 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0827  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.17 
 
 		 189 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1292 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0850  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.41 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.764335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0862  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.41 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  31.43 
 
 		 388 aa  41.2  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  42.31 
 
 		 288 aa  41.2  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0487  methylation  30 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.856332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  29.82 
 
 		 226 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  32.81 
 
 		 253 aa  40.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>